Nhiệm vụ của AGILE là quan sát các nguồn tia gamma trong vũ trụ. Các mục tiêu khoa học chính của Sứ mệnh AGILE bao gồm nghiên cứu về:[2] Hoạt động hạt nhân Galactic; Vụ nổ tia gamma; Nguồn tia X và tia gamma; Nguồn gamma không được xác định; Phát xạ gamma thiên hà khuếch tán; Khuếch tán phát xạ gamma ngoài thiên hà khuếch tán; và Vật lý cơ bản